孙一奎（1522～1619年），明代著名中医学家。字文垣，号东宿，别号生生子。安徽休宁人。生活于明嘉靖万历年间。为汪石山的再传弟子。
孙氏自幼聪颖，好学勤求，为寻师访友，曾远历湘赣江浙等地，广询博采，访问名贤，探冥搜奇，经三十年，不但为人治病多验，而且在学术理论上颇有建树，尤其对命门、三焦等理论研究，均有个人见地，为人决死生多能效验，临证投剂屡起沉疴，学验俱丰，故名噪当时。著述有《赤水玄珠》30卷，《医旨绪余》2卷及《孙氏医案》5卷。
《孙一奎医学全书》主要包括：《赤水玄珠》30卷。此书以明证为主，论述内、外、妇、儿各科病症70余门。先以《内经》及各家学说为前引，继之结合个人经验分述因、证、方药，并附诸家经验。对于寒热、虚实、表里、气血八端，辨析最详。另对古今病证名相混之处，论辨也较细密。选方用药切合病证。还记载了孙氏所创温补下元的“壮元汤”、“壮元散”等，反映了孙氏重视温补的学术特点。是一本颇具理论及临床价值的中医名著，后世医家多所推重。
《医旨绪余》2卷。共78篇论文，为孙氏医论专辑。立论宗《内》《难》，而参《易》（宋明理学），主要以脏腑、气血、经络、腧穴推明阴阳五行之理，对命门、相火的阐述，尤为详尽，首创“命门动气论”，又倡“不执方论”，并对前代诸家学说，作出了较为公正的评述。
《孙氏医案》5卷，又名《孙文垣医案》。系由门人余煌、徐景奇，及其子泰来、朋来将孙氏治验按先后顺序汇编而成。《医案》以行医地名命集，以诊治时间为序，计《三吴治验》2卷，《新都治验》2卷，《宜兴治验》1卷，总共收载398案。不少病例，疗效卓著，且案中多夹议论，阐发证治，总结了孙氏的临证经验。
《孙一奎医学全书》，是一本较全面、系统，有分析、有见解的总结、整理和研究孙氏学术经验的书籍。适合于各级各类中医工作者，中医院校师生及中医爱好者阅读参考。